MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008340	GTC	2	6	46071	46076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319206
1002	NC_008340	TCA	2	6	46160	46165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319206
1003	NC_008340	AGC	2	6	46189	46194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319206
1004	NC_008340	TGC	2	6	46244	46249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319206
1005	NC_008340	CGA	2	6	46259	46264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319206
1006	NC_008340	ATCGC	2	10	46267	46276	20 %	20 %	20 %	40 %	114319206
1007	NC_008340	AGCC	2	8	46342	46349	25 %	0 %	25 %	50 %	114319206
1008	NC_008340	CG	3	6	46484	46489	0 %	0 %	50 %	50 %	114319206
1009	NC_008340	GGC	2	6	46554	46559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319206
1010	NC_008340	GCC	2	6	46600	46605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319207
1011	NC_008340	GGC	3	9	46616	46624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319207
1012	NC_008340	GCC	2	6	46701	46706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319207
1013	NC_008340	GTA	2	6	46736	46741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319207
1014	NC_008340	GC	3	6	46746	46751	0 %	0 %	50 %	50 %	114319207
1015	NC_008340	CCG	2	6	46790	46795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319207
1016	NC_008340	GAA	2	6	46844	46849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319207
1017	NC_008340	GCTG	2	8	46920	46927	0 %	25 %	50 %	25 %	114319207
1018	NC_008340	CGT	2	6	46996	47001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319207
1019	NC_008340	GC	3	6	47023	47028	0 %	0 %	50 %	50 %	114319207
1020	NC_008340	GCTCCG	2	12	47059	47070	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114319207
1021	NC_008340	GCAG	2	8	47077	47084	25 %	0 %	50 %	25 %	114319207
1022	NC_008340	GTA	2	6	47110	47115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319207
1023	NC_008340	ACAA	2	8	47142	47149	75 %	0 %	0 %	25 %	114319207
1024	NC_008340	CAGC	2	8	47150	47157	25 %	0 %	25 %	50 %	114319207
1025	NC_008340	TCC	2	6	47175	47180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319207
1026	NC_008340	AGCC	2	8	47202	47209	25 %	0 %	25 %	50 %	114319207
1027	NC_008340	CCA	2	6	47272	47277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319207
1028	NC_008340	GCG	2	6	47308	47313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319207
1029	NC_008340	AGC	2	6	47397	47402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319207
1030	NC_008340	GCC	2	6	47430	47435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319207
1031	NC_008340	GC	3	6	47443	47448	0 %	0 %	50 %	50 %	114319207
1032	NC_008340	CCT	2	6	47541	47546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319208
1033	NC_008340	GCC	2	6	47639	47644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319208
1034	NC_008340	GCCCGA	2	12	47647	47658	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114319208
1035	NC_008340	TGA	2	6	47727	47732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319208
1036	NC_008340	GCC	2	6	47737	47742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319208
1037	NC_008340	CGC	2	6	47897	47902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319208
1038	NC_008340	TCG	2	6	47924	47929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319208
1039	NC_008340	GGC	2	6	47976	47981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319208
1040	NC_008340	GGCTGC	2	12	48102	48113	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114319208
1041	NC_008340	GCA	2	6	48114	48119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319208
1042	NC_008340	CCGG	2	8	48178	48185	0 %	0 %	50 %	50 %	114319208
1043	NC_008340	CGA	2	6	48222	48227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319208
1044	NC_008340	CCG	2	6	48260	48265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319208
1045	NC_008340	GGCCC	2	10	48272	48281	0 %	0 %	40 %	60 %	114319208
1046	NC_008340	CGG	2	6	48324	48329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319208
1047	NC_008340	CAC	2	6	48403	48408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319208
1048	NC_008340	AG	3	6	49106	49111	50 %	0 %	50 %	0 %	114319209
1049	NC_008340	GCT	2	6	49177	49182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319209
1050	NC_008340	GGT	2	6	49183	49188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319209
1051	NC_008340	GAG	2	6	49211	49216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319209
1052	NC_008340	GAG	2	6	49226	49231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319209
1053	NC_008340	CGG	2	6	49236	49241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319209
1054	NC_008340	AAC	2	6	49256	49261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319209
1055	NC_008340	GGGCCT	2	12	49285	49296	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114319209
1056	NC_008340	CAG	2	6	49403	49408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319209
1057	NC_008340	TGG	2	6	49428	49433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319209
1058	NC_008340	GCAG	2	8	49491	49498	25 %	0 %	50 %	25 %	114319209
1059	NC_008340	CTG	2	6	49508	49513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319209
1060	NC_008340	GGA	2	6	49543	49548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319209
1061	NC_008340	GAC	2	6	49574	49579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319209
1062	NC_008340	CTG	2	6	49674	49679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319210
1063	NC_008340	CGA	2	6	49715	49720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319210
1064	NC_008340	TCA	2	6	49756	49761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319210
1065	NC_008340	GCT	2	6	49766	49771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319210
1066	NC_008340	GAG	2	6	49785	49790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319210
1067	NC_008340	CGC	2	6	49792	49797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319210
1068	NC_008340	GGT	2	6	49811	49816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319210
1069	NC_008340	GAT	2	6	49823	49828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319210
1070	NC_008340	GCA	2	6	49853	49858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319210
1071	NC_008340	CCT	2	6	49967	49972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319210
1072	NC_008340	AGG	2	6	49984	49989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319210
1073	NC_008340	GGA	2	6	49997	50002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319210
1074	NC_008340	CGG	2	6	50075	50080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319210
1075	NC_008340	CAC	2	6	50123	50128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319210
1076	NC_008340	CTC	2	6	50142	50147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319210
1077	NC_008340	GCC	2	6	50157	50162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319210
1078	NC_008340	TCG	2	6	50193	50198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319210
1079	NC_008340	TTC	2	6	50211	50216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319210
1080	NC_008340	GCC	2	6	50259	50264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319210
1081	NC_008340	CTG	2	6	50352	50357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319210
1082	NC_008340	CG	3	6	50489	50494	0 %	0 %	50 %	50 %	114319210
1083	NC_008340	CAT	2	6	50513	50518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319210
1084	NC_008340	GCG	2	6	50530	50535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319210
1085	NC_008340	ACCG	2	8	50616	50623	25 %	0 %	25 %	50 %	114319210
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1087	NC_008340	CTT	2	6	50693	50698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319210
1088	NC_008340	CGG	2	6	50740	50745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319210
1089	NC_008340	CG	3	6	50751	50756	0 %	0 %	50 %	50 %	114319210
1090	NC_008340	TCG	2	6	50800	50805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319210
1091	NC_008340	TCGCC	2	10	50810	50819	0 %	20 %	20 %	60 %	114319210
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1094	NC_008340	GC	3	6	50963	50968	0 %	0 %	50 %	50 %	114319210
1095	NC_008340	TCCA	2	8	50973	50980	25 %	25 %	0 %	50 %	114319210
1096	NC_008340	GTCG	2	8	51078	51085	0 %	25 %	50 %	25 %	114319210
1097	NC_008340	G	7	7	51158	51164	0 %	0 %	100 %	0 %	114319211
1098	NC_008340	CCG	3	9	51187	51195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319211
1099	NC_008340	GGT	2	6	51198	51203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319211
1100	NC_008340	ATCGA	2	10	51210	51219	40 %	20 %	20 %	20 %	114319211
1101	NC_008340	CTGCGC	2	12	51263	51274	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114319211
1102	NC_008340	TGG	2	6	51289	51294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319211
1103	NC_008340	ACG	2	6	51301	51306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319211
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1105	NC_008340	GCCG	2	8	51425	51432	0 %	0 %	50 %	50 %	114319211
1106	NC_008340	CAC	2	6	51485	51490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319211
1107	NC_008340	CTA	2	6	51567	51572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319212
1108	NC_008340	CTTC	2	8	51588	51595	0 %	50 %	0 %	50 %	114319212
1109	NC_008340	AGG	2	6	51599	51604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319212
1110	NC_008340	GAC	2	6	51661	51666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319212
1111	NC_008340	GGA	2	6	51729	51734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319212
1112	NC_008340	TGCGT	2	10	51837	51846	0 %	40 %	40 %	20 %	114319212
1113	NC_008340	CG	3	6	51863	51868	0 %	0 %	50 %	50 %	114319212
1114	NC_008340	AGCC	2	8	51883	51890	25 %	0 %	25 %	50 %	114319212
1115	NC_008340	ACG	2	6	51926	51931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319212
1116	NC_008340	GCCG	2	8	52041	52048	0 %	0 %	50 %	50 %	114319212
1117	NC_008340	GC	3	6	52087	52092	0 %	0 %	50 %	50 %	114319212
1118	NC_008340	GCA	2	6	52110	52115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319212
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1120	NC_008340	CTG	2	6	52210	52215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319212
1121	NC_008340	TCC	2	6	52250	52255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319212
1122	NC_008340	GCC	2	6	52312	52317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319212
1123	NC_008340	GGC	2	6	52329	52334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319212
1124	NC_008340	CGA	2	6	52335	52340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319212
1125	NC_008340	CGG	2	6	52424	52429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319212
1126	NC_008340	TGACC	2	10	52461	52470	20 %	20 %	20 %	40 %	114319212
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1128	NC_008340	CCG	2	6	52593	52598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319212
1129	NC_008340	GC	3	6	52654	52659	0 %	0 %	50 %	50 %	114319212
1130	NC_008340	TAC	2	6	52660	52665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319212
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1133	NC_008340	CGG	2	6	52792	52797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319212
1134	NC_008340	CGA	2	6	52839	52844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319212
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1242	NC_008340	TCG	2	6	57245	57250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319217
1243	NC_008340	CAG	2	6	57280	57285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319217
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1246	NC_008340	GAG	2	6	57472	57477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319217
1247	NC_008340	CT	3	6	57511	57516	0 %	50 %	0 %	50 %	114319217
1248	NC_008340	CGA	2	6	57534	57539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319217
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1359	NC_008340	CCTC	2	8	62080	62087	0 %	25 %	0 %	75 %	114319221
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